O&O Defrag Server Edition není jen ideálním, speciálně vytvořeným defragmentačním software pro servery, ale nabízí i nástroje pro síťovou správu které umožňují centrální distribuci a řízení O&O Defrag v sítích. Součástí O&O Defrag je vlastní softwarový distribuční systém (O&O ComponentInstaller) umožňující rychlou a snadnou distribuci software v síti.

Součástí O&O Defrag Server Edition je jako klientský software speciální O&O Defrag agent. Tento agent je potřeba instalovat pouze jednou, veškerá další komunikace je řízena prostřednictvím konzoly. Pokaždé, když konzola nalezne počítač na kterém dosud nebyl agent instalován, nabídne správci jeho instalaci. Není potřeba žádný další software nebo konfigurace. Vše je provedeno automaticky a plně začleněno do bezpečnostního konceptu Windows.

Jednou z nejdůležitějších nových vlastností je typ komunikace mezi různými elementy programu. Poruchový, patentovaný a málo bezpečný DCOM komunikační protokol byl plně nahrazen standardním TCP/IP protokolem. Tímto je zajištěna dodatečná ochrana před nebezpečími jako je W32.blaster virus a O&O Defrag se tak začleňuje do bezpečnostního konceptu každé společnosti.

O&O Defrag Server Edition optimalizuje pevné disky všech verzí systémů Windows 2003, Windows XP a Windows 2000.